根據距今300年前的資料所示，當時這一帶是一片廣闊的草原，被稱為「仙遊之原」（senyuugahara)。出生於善通寺的弘法大師自幼在此遊玩，以泥土捏塑佛像，用雜草樹枝搭建正殿，小石頭堆疊為塔。四國八十八所靈場第七十四號札所甲山寺就位於此處。
根據甲山寺的創建及史料記載，距今1,200年前弘法大師為創建寺院前往甲山附近勘地時，從石窟裡忽然出現一位聖者對弘法大師說「在這裡建造寺院吧」，日後弘法大師便在此處安置了一尊毘沙門天像，這就是甲山寺的起源。因此有甲山寺起源於大師堂左側的洞窟一說。
後來弘法大師受命修築日本最大規模的貯水池「滿濃池」，並在甲山的石窟中舉辦祈求修築工程平安順利的儀式。滿濃池修築工程受到大師信徒的傾力相助，僅花費三個月便完工，為紀念順利完工當時還特別在此建造寺廟，供奉藥師如來神像。